小型水库下放到乡镇由个人承包管理后，水库水资源的利用率提高了，政府财政投入的日常管理费用降低了，县、乡水务部门也省事了。然而，这也陆续暴露出一些亟待解决的新问题，“政府防汛指挥的软化”就是其中之一。

所谓政府防汛指挥软化，是指小型水库承包者往往以拥有经营自主权为借口，不情愿甚至不服从县、乡防汛指挥机构的统一指挥。当大洪水到来、防汛指挥机构要求开闸泄洪时，为了尽可能多地蓄水受益，有些小型水库承包者拒绝开闸泄洪。

为此，各级政府必须高度重视“政府防汛指挥软化”的问题，想方设法强化防汛抗洪的统一指挥，切实让小型水库的防汛指挥“硬”起来。

各级要结合水库管理体制改革，切实抓好政府防汛指挥权的落实。要把“无条件服从政府的防汛指挥调度”写入承包合同中。对不服从防汛指挥机构统一指挥的，轻者取消其水库承包资格，重者依法追究其法律责任。

每座小型水库至少要配备一名专职水务管理员，水务管理员作为县、乡水利部门的派出人员，主要负责小型水库的防汛、抗旱以及对承包者经营方向实施监督等工作。为使防洪保安开闸泄洪及时，汛期的水库闸门开关权交由水务管理员，即：水务管理员代表县、乡防汛指挥机构单独掌握水库闸门的“钥匙”，水库承包人不得干预。

县、乡防汛指挥机构要结合自己的实际情况制定严格的水库巡查制度，特别在主汛期，一定要加大巡查力度，做到正常情况下每座小型水库每周不少于一次现场巡查，特殊情况下每天至少进行一次现场巡查。在巡查中如果发现不按防汛指挥机构的要求行事（如该放水而不放水）的，要严肃追究水务管理员和承包者的责任，通过严格管理，以确保小型水库的安全度汛。