黄臧寺（流量站）坝址位于黑河上游东、西岔汇合后的干流上，上距黄臧寺村11km，下距大孤山坝址约50km，左岸为甘肃省肃南县，右岸为青海省祁连县，控制流域面积7648km²，坝址处天然年径流量12.4亿m³。

    坝址位于峡谷进口以下1km处，库区为一山间盆地，长16km，宽1.0—1.5km。在回水不影响祁连县城情况下，当水位2655m时（坝高约143m），库面面积18km²，最大库容可以达到7.4亿m³。库周及库盆均为弱透水性岩石，白垩系砂砾岩之下有弱透水性的 页岩，产生库区渗漏问题的可能性不大。坝址两岸山岩，均是堆石坝材料来源，数量足够，库区河滩有丰富的混凝土骨料和坝体砂砾料，经勘探和材料试验，数量和质量都能满足需要，防渗土料分布于库区IV级阶地之上，数量有限。

    上游山区水库的开发任务为：合理向中下游供水、替代平原水库、促进灌区节水改造，兼顾发电。